有c及c1都是線粒體細胞色素，二者的光譜性質十分近似，二者的輔基和與酶蛋白的聯接方式都相同。c1單體分子量為38 000，c1是以多聚體存在，無論是單體還是多聚體，都不能與aa3起反應。細胞色素c是分子量最小的細胞色素，由于它的分子量小，是可溶的，容易提取純化，所以研究比較多，對其結構也最清楚，已測定50多種生物的細胞色素c的一級結構，對它的高級結構也進行過詳細研究。脊椎動物的細胞色素c由104個殘基組成。植物的細胞色素c由112個殘基組成。人及黑猩猩的細胞色素c完全一樣，盡管各種生物的細胞色素c的殘基有許多變化。但其立體結構則基本一致。