細胞質的各種成分如何相互作用以允許細胞器運動同時保持細胞結構仍不確定。細胞質成分的流動在許多依賴于細胞質滲透性的細胞功能中起著重要作用。
這種功能的一個例子是細胞信號傳導,這一過程取決于允許信號分子在細胞中擴散的方式。雖然像鈣離子這樣的小信號分子能夠輕松擴散,但較大的分子和亞細胞結構通常需要幫助才能穿過細胞質。這種粒子的不規則動力學引起了關于細胞質性質的各種理論。