細菌的接種方法有很多種，如劃線法、涂布法、傾注法、斜面接種法、液體培養基接種法、螺旋接種法等，其方法和應用各有不同，下面進行解釋以幫助實驗人員選擇操作。
劃線法：此法主要用于菌種分純，獲得單菌落
由接種環沾取少許待分離的材料，在無菌平板表面進行平行劃線、扇形劃線或其他形式的連續劃線，微生物細胞數量將隨著劃線次數的增加而減少，并逐步分散開來，如果劃線適宜的話，微生物能一一分散，經培養后，可在平板表面得到單菌落。
圖：劃線法培養細菌圖
優點：可以觀察菌落特征，對混合菌進行分離。
缺點：不能用于菌落計數。
涂布法：此法主要用于菌落總數計數
先將培養基熔化后趁熱倒入無菌平板中，然后用無菌吸管吸取0.1ml菌液接種在已凝固的瓊脂平板上。再用無菌L型玻璃棒將菌液在平板上涂抹均勻，將涂抹好的平板平放于桌上20~30min，使菌液滲透入培養基內，然后將平板倒轉，保溫培養，至長出菌落后即可計數。
優點：可以計數，可以觀察菌落特征。
缺點：接種前需梯度稀釋，吸收量較少，較麻煩，平板不干燥效果不好，容易蔓延。