1.MALDI-TOF MS：即基質輔助激光解析電離飛行時間質譜技術。質譜儀離子源中的樣品，在極高的真空狀態下，用瞬時納秒強光激發，使待測樣品離子化，經電壓加速和聚焦導入質量分析器。質量分析器根據離子質荷比的不同進行分離。分離的離子進入檢測器后，產生放大的電流，來測定離子強度或豐度。質譜圖縱坐標為離子相對強度，橫坐標為質荷比。MALDI -TOF MS根據離子在得到能量后到達檢測器的時間來反映離子的不同質量，二者成反比。
2.鑒定方法：通過檢測細菌特異性保守核糖體蛋白（核酸、蛋白、糖類、脂肪酸）進行菌種鑒定。