（1）先做主動脈根部斜行切口，如上所述，將右冠瓣牽向前方，顯露肥厚的室間隔組織。
（2）應用小圓刀片在右冠瓣下方的室間隔作肌肉切口，直接向下方延伸，向下方延伸切口時，應在直視下進行。注意不要向右下，以避免損傷希氏束或左束支。
（3）應用紗布墊將左室抬高，術者以示指經主動脈瓣口伸入左室腔，判明病變情況。捫診發現左室流出道肌性梗阻范圍較一般深，或當切除肥厚肌塊后，下方仍有殘余的阻塞，需要切除乳頭肌基部至心尖的肥厚肌塊時，都應加左室切口。
（4）選擇左室前壁少血管區和便于顯露室間隔的部位做室壁切口，此切口一般位于左前壁中下1/3交界區并和冠狀動脈前降支平行，長約25mm，于前乳頭肌下緣進入心室腔。小心牽拉切口兩緣，顯露心室內部結構，找到二尖瓣前葉，將其牽開到室間隔左方，應用10號刀片，分別切除左室前壁切口兩側的肥厚心肌，并從下而上由室間隔前方切除肥厚肌肉。切口將形成一個深的肌肉溝伸向流出道，使之和經主動脈做的上方切口相連接，肌塊切除深度一般為15～20mm。
（5）清除切口內肌肉碎塊：將示指再次經主動脈瓣口伸入左室流出道探查，滿意后應用帶小墊片縫線間斷褥式縫合左室切口，每針必須穿過全層心室壁，全部縫線置好后再結扎。
（6）應用4-0單絲縫線連續縫合主動脈切口，排除心腔和主動脈內積氣，其余步驟按常規進行。
應用主動脈和左室分別切口的優點是能在直視下切除足夠的肥厚心肌組織，特別是解除室間隔下方的梗阻更為方便，但左室切口對術后心功能有一定影響，所以能經主動脈切口充分解除左室流出道梗阻時，不必加用左室切口。