對于有劑量要求的干細胞移植方案而言，精確的干細胞計數顯然十分重要。研究表明，需要輸入病人體內的 CD34陽性細胞量取決于病人的體重，每公斤體重應輸入2百萬至5百萬個CD34陽性細胞。此重要性也顯示在動員及白細胞分離過程中，如通過計數細胞水平判斷動員是否成功、何時為最佳采集時間以及采集到的干細胞數量是否足夠等等。由于干細胞所占的比例很小，在外周血中不到0.1%，在骨髓中也只占單個核細胞的1%至4%，因此利用流式細胞儀在大量細胞中快速準確地篩選并測出干細胞的絕對數量對于干細胞移植具有重要意義
