手術治療的優點是單次治療即可清除所有的疣體。醫生需要接受系統的臨床訓練，需要配備必要的設備，而且治療所花時間要長。通常在局部麻醉后應用電灼器將疣體清除，術中無需止血。電灼時應注意控制治療深度，以防止術后形成瘢痕。另外，也可應用精細的手術剪或手術刀去除疣體，由于大部分疣體為外生性生長，去除疣體所產生的創面僅達淺層真皮。止血可用電灼或化學止血藥（如氯化鋁溶液）。如果手術完成得好，大部分病人無需縫合創面。手術治療最適合于數量多或面積大的生殖器尖銳濕疣患者。而對于疣體分布廣泛或尿道疣的患者，如對于其他治療方法無效，也可以應用二氧化碳激光或手術治療。
干擾素具有抗病毒和/或免疫**作用，目前天然型和重組型干擾素均已用于生殖器尖銳濕疣的治療。用法有兩種：全身用藥（即皮下注射或肌肉注射）和疣體內注射。全身用藥效果不佳。疣體內注射干擾素的有效率和復發率與其他治療方法類似，但在注射部位易出現燒灼感和刺痛感。由于使用不便和全身反應較大，干擾素治療不作為一線治療方法給予推薦。
上述各種治療方法都或多或少的存在一定的缺點，不少醫生喜歡采用幾種方法聯合應用（即針對同一個疣體同時應用兩種或兩種以上的方法進行治療）。目前尚無證據證明聯合治療能夠增進療效，而且一些專家認為，聯合治療可能會增加并發癥的發生幾率。
子宮頸尖銳濕疣的推薦治療
對患有子宮頸外生性尖銳濕疣的女性，在治療前首先應先排除有無高分級SIL的可能。在專家的咨詢下選擇合適的治療方案。
**尖銳濕疣的推薦治療
1、液氮冷凍療法。不推薦使用冷凍探針，因為容易引起**壁穿孔，形成瘺道。
2、80%-90%TCA或BCA涂抹疣體。將少許藥液直接涂至疣體上，任其風干，此時可見疣體上覆“白霜”.如果所涂藥物過多，可用滑石粉、碳酸氫鈉溶液或肥皂水清除治療區域殘存的酸性藥物。如果需要每周可重復1次。
尿道口尖銳濕疣的推薦治療
1、液氮冷凍療法。
2、10%--25%鬼臼樹脂安息香復合酊劑。將少許藥液直接涂至疣體上，任其風干，不要讓藥液粘附到正常黏膜上。如果需要每周可重復1次。孕婦使用之安全性仍未被確定。
有關Podofilox（普達非洛）和咪喹莫特治療尿道口尖銳濕疣的評估資料有限，一些專家仍建議可以用于部分病人。
**尖銳濕疣的推薦治療
1、 液氮冷凍。
2、 80%--90%TCA或BCA涂抹疣體。
3、 手術切除。很多**黏膜尖銳濕疣患者同時合并有直腸黏膜尖銳濕疣，治療前或治療中應通過**指診或**鏡檢查直腸黏膜。
專業咨詢
生殖器HPV感染
對于患生殖器尖銳濕疣的患者，必要的專業教育和咨詢是很重要的。可以通過宣傳手冊、咨詢熱線或專業網站等形式對患者進行教育。
應使病人了解以下關鍵信息
* 生殖器HPV感染常見于性生活頻繁的成年人。大部分性生活頻繁的成年人在其一生中都會感染HPV,大部分人由于沒有任何癥狀或對此了解太少，因而不曾察覺。
* 生殖器HPV感染通常通過性生活傳播。潛伏期（從感染病毒到發病之間的時間間隔）長短差異很大，要想確定感染的具體時間和傳染源往往很困難。當病人確診有生殖器HPV感染時，其**通常已經被傳染了，只是因為沒有任何癥狀或體征，沒有發現而已。
* 目前對于患者的**還沒有可推薦的HPV檢測方法，以明確是否受到HPV感染。盡管HPV感染通常通過性生活傳播給**，但是一般可以自然痊愈。
生殖器尖銳濕疣
生殖器尖銳濕疣常由專門類型的HPV感染所致。這些特殊類型的HPV通常不會引起宮頸癌和其他**生殖器癌。
盡管感染了這些類型的HPV,但一些人可能不會發病，而另一些人則會出現生殖器尖銳濕疣，為什么會這樣呢？目前尚不清楚，可能人自身的免疫功能在其中扮演了重要角色。
生殖器尖銳濕疣屬于良性病變，但在治療后的前幾個月內常會出現復發。治療可以減輕HPV感染，但能否降低HPV傳染給**的幾率尚不清楚。治療后傳染性的持續時間還不知道。
性生活時使用安全套會減少HPV感染相關疾病（如生殖器尖銳濕疣和宮頸癌等）的發病幾率。盡管使用了安全套，但未被保護的區域仍然會感染HPV,如陰囊、女性外陰或**周圍等。患有生殖器尖銳濕疣的女性病人無需進行**脫落細胞染色檢查（巴氏試驗）或**鏡檢查。
隨訪
生殖器尖銳濕疣治療后仍需要進行隨訪評估。應告知病人留意有無復發，治療后頭三個月內復發最為多見。因為外生殖器尖銳濕疣有時很難辨認，因此治療后3個月時來醫院進行隨訪復查是很有意義的。當然治療后更早期的隨訪也是有用的，可以了解治療是否徹底以及有無并發癥。非生殖器部位患有尖銳濕疣的女性病人應告知其定期行巴氏試驗篩查。
**的處置措施
對生殖器尖銳濕疣患者的**進行檢查是沒有必要的，因為沒有證據顯示再次感染在復發中扮演角色。另外，通過治療能否降低生殖器尖銳濕疣的傳染性目前還不清楚，單純為預防傳染而進行的治療也不推薦使用。對生殖器尖銳濕疣患者的**進行必要的咨詢和檢查，可以了解其是否也患有生殖器尖銳濕疣及其他性傳播疾病。通過咨詢可以使**：1）了解HPV感染很常見，可能在配偶之間進行傳播；2）接受性傳播疾病的檢查，如果**為女性，還須同時進行巴氏試驗篩查，通過脫落細胞染色檢查以排除有無宮頸癌的可能。
特殊情況
妊娠
女性懷孕期間禁止使用咪喹莫特、鬼臼樹脂和Pdofilox（普達非洛）。由于生殖器尖銳濕疣在女性懷孕期間可能會進一步增生而且變得更加易碎，很多專家主張應在孕期內將病灶清除。6、11型HPV可引起嬰兒和兒童呼吸系統**狀瘤病，感染途徑（如經胎盤，圍產期或出生后）還不完全清楚。剖腹產能否避免小兒呼吸系統**狀瘤病的發生還沒有定論，不能作為預防性措施來施行。孕婦患有生殖器尖銳濕疣，如同時存在骨盆出口梗阻或經**分娩有大出血的可能，此時可考慮行剖腹產。患有生殖器尖銳濕疣的孕婦所生的孩子有發生喉部尖銳濕疣（可繼發呼吸系統**狀瘤病）的可能性，但發生幾率很小，目前尚沒有對照性研究能夠證實選擇剖宮產可以避免這種情況的發生，這一點應提前告知病人。
HIV感染
HIV感染者如患有外生殖器尖銳濕疣，在治療上沒有什么特殊。但是由于HIV感染者存在免疫抑制，一旦發生尖銳濕疣，疣體的體積會更大，疣體的數量會更多，而且治療后復發的幾率也會更大。有免疫抑制的患者一旦發生生殖器尖銳濕疣，則惡變形成鱗狀細胞癌的可能性大大增加，治療前必須行活組織檢查。由于感染HIV的男性同性戀患者發生**癌的幾率增加，一些專家推薦應用細胞學檢查以篩查**SIL.
鱗狀細胞原位癌
診斷為生殖器鱗狀細胞原位癌的患者應找專家進行治療。局部病灶燒灼通常有效，但治療后嚴密隨訪更為重要。對于有免疫能力的患者，外生殖器鱗狀細胞原位癌轉化為浸潤性鱗狀細胞癌的可能性很小。如患者為男性，其女**發生宮頸異常的風險很大。