1、不均一耐藥性
MRSA菌落內細菌存在敏感和耐藥兩個亞群，即一株MRSA中只有一小部分細菌約10－4～10－7，對甲氧西林高度耐藥，在50 μg/ml甲氧西林條件下尚能生存，而菌落中大多數細菌對甲氧西林敏感，在使用抗生素后的幾小時內大量敏感菌被殺死，但少數耐藥菌株卻緩慢生長，在數小時后又迅速增殖。
2、廣譜耐藥性
MRSA除對甲氧西林耐藥外，對其它所有與甲氧西林相同結構的β-內酰胺類和頭孢類抗生素均耐藥，MRSA還可通過改變抗生素作用靶位，產生修飾酶，降低膜通透性產生大量PABA等不同機制[3]，對氨基糖苷類、大環內酯類、四環素類、氟喹喏酮類、磺胺類、利福平均產生不同程度的耐藥，唯對萬古霉素敏感。
3、生長特殊性
MRSA生長緩慢，在30°C，培養基pH 7.0及高滲(40 g/L NaCl溶液)條件下生長較快[4]。在30°C時，不均一耐藥株表現為均一耐藥和高度耐藥，在37°C又恢復不均一耐藥。均一耐藥株在>37°C或pH<5.2時，均一耐藥性可被抑制而表現為敏感。增加NaCl濃度，低溫孵育和延長時間，可使不均一耐藥株群體中敏感亞群中的耐藥性得到充分表達，即能耐受較高濃度的甲氧西林，而對其中耐藥亞群無影響[5]。但最近也有報道，高滲下延長培養時間，會影響MRSA的檢出結果，因為在高鹽情況下，培養48 h，對甲氧西林敏感的金黃色葡萄球菌(methicillin sensitive Staphylococcus aureus；MSSA)易產生大量β-內酰胺酶，可緩慢水解甲氧西林，導致細菌生長，而誤認為MRSA。所以一般MRSA在高鹽環境孵育24 h，而耐甲氧西林凝固酶陰性葡萄球菌(MRCNS)由于耐藥亞群菌數少于金葡菌，應孵育48小時觀察結果。