耶爾森氏菌病發病載體共有5型，1型和5型多為非致病株，2、3、4型為致病株。中國分離到O∶3和O∶9血清型菌株均為生物3型，而國外分別為生物4型和2型，構成國內外致病性的差異。
噬菌體
中國1981年分離出第一株耶氏菌噬菌體，1983年又分離出42株噬菌體，這些噬菌體是以O∶3型耶氏菌為指示菌分離的，裂解范圍很狹窄，在15℃只裂解O∶3型耶氏菌，其他47個血清型均不裂解，對鼠疫耶氏菌、假結核耶氏菌、大腸菌、志賀氏菌、沙門氏菌也不裂解。以后以48型耶氏菌為指示菌，從231份豬便，分離出110株噬菌體，這些噬菌體裂解范圍各不相同，其中兩株噬菌體(JA和HB)裂解范圍廣，兩者混合后，可裂解各型耶氏菌的97%，而對580株其他腸道菌的裂解率不到1%，故可作為耶氏菌的初步診斷和鑒定用。噬菌體對增菌培養的影響。耶氏菌分離常用增菌培養法，以提高檢出率。如被檢標本中有噬菌體存在，則會降低檢菌率，反而不如直接平板培養法高。噬菌體作用下典型耶氏菌向非典型耶氏菌轉變。據報道，32株O∶3型耶氏菌經本型菌噬菌體作用后，有3株再生菌生化反應發生變化，能分解鼠李糖、蔗糖，不分解蜜二糖。根據Brenner等(1980年)分類法，這3株轉變為弗氏耶氏菌(Yersinia frederiksenii)，這種情況在自然界和體內都可能存在。