聚丙烯酰胺凝膠可用作非凝血酶原粒化劑，外科，隱形眼鏡原料，微膠囊的外層包復料，并用作制造高質量的止血拴，婦女衛生巾及小兒尿布等。粒度幾百微米到幾十微米的聚丙烯酰胺可用于色譜填料（例如凝膠色譜柱填料)），可有效地分離細胞色素等球形蛋白質。并能進一步對蛋白質脫鹽、濃縮等。聚丙烯酰胺樹脂經 Mannich反應，在酰胺基側鏈上經亞甲基橋引入L-脯氨酸或L-羥脯氨酸，在與銅離子配位，得到手性配體樹脂，它對一系列DL-氨基酸進行有效拆分。經Hofmann降解得到的聚乙烯胺樹脂上手性氨基酸再與銅離子絡合， 作為配體交換色譜的固定相，可對一系列氨基酸進行拆分，對芳香氨基酸的拆分效果尤佳，由于骨架的親水性較強，大大縮短了拆分時間。