實驗原理:PCR擴增是模擬天然DNA復制過程,利用DNA聚合酶在體外(試管中)擴增一對引物之間特異性DNA片段的方法。其主要熱循環過程可分為三個步驟:
(1)高溫變性(denature):提供DNA復制的有效模板。
(2)低溫退火(anneal):引物與模板DNA復性,提供游離3’-OH端供DNA復制起始;
(3)中溫延伸(extend):依賴Mg2+,DNA聚合酶催化合成與模板互補的新的DNA分子。
以上變性、退火、延伸三個過程組成一個循環周期;常循環25~40周期,經過n輪循環后,靶DNA的拷貝數理論上呈2n增長;循環進行完畢,通常zui后還在DNA聚合酶zui適溫度下延伸5~10分鐘。
操作步驟:本次實驗程序如下:
(1)標記一個潔凈的200uL反應管,向其中依次加入:
ddH2O 36 uL
10×PCR反應緩沖液 5uL
2mmol/L dNTPs 5uL
上游引物 1uL
下游引物 1uL
DNA模板 1uL
Taq DNA聚合酶 1 uL
總體積:50uL
混合均勻后,蓋緊管蓋,離心5S,使反應成份均勻富集于管底。
(2) 加石蠟油50~100μl于反應液表面以防蒸發(此步驟根據PCR儀而定,如帶高溫熱蓋PCR儀不需加入)。
(3) 在PCR儀上設置反應循環參數,本次實驗為:94℃ 30s,56℃ 30s,72℃ 30s,循環數為30,zui后于72℃充分延伸10 min后終止反應(16℃ 3 min)。
(4) 置反應管于PCR儀上進行熱循環。
(5) 反應完畢后,常取5~10%反應產物(如本次5uL)進行瓊脂糖凝膠電泳,通過溴乙錠染色,在紫外燈下觀察擴增產物的質量,正常DNA電泳帶應清晰、整齊,并通過與已知分子量大小的DNA標志物比較,初步了解產物大小是否與預期吻合。
注意事項:
1. 戴手套操作,避免污染
2.冰上操作
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