從1964年由肉毒桿菌中分離出毒素結晶至今已獲得七種（A，B，C，D，E，F和G）類型的毒素，能引起人員中毒的主要是A、B和E型毒素，其中以A型軍用意義最大，A型結晶毒素是由19種氨基酸組成的單一蛋白質，分子量為90～120萬，化學結構尚不清楚。
SDS-PAGE電泳結果顯示有分子量不同的帶,為構成C型肉毒前體毒素的各亞基。其中分子量為100kD的帶是神經毒素的重鏈,分子量為50kD的帶是神經毒素的輕鏈,其它分子量不等的帶為血凝素各亞單位和非血凝素非毒素成份。它們對保持C型肉毒神經毒素的穩定和毒性作用的發揮起主要作用。