1、從肉眼觀察肌肉組織的大體特點，例如送檢肌肉組織的大小、數量、色澤、切面、質地等相關信息，從取材中可以給出初步的病理診斷；
2、將肌肉組織取材后制成石蠟切片，在顯微鏡下進行觀察，可以明確是否為炎癥性病變，如慢性炎、急性炎、肉芽腫性炎，以及是否伴有出血、壞死、鈣化等等病變；是否為良性腫瘤，如橫紋肌瘤、纖維瘤、血管瘤、血管內皮瘤、炎性肌纖維母細胞瘤等病變；是否為惡性腫瘤，如橫紋肌肉瘤、纖維肉瘤、惡性纖維組織細胞瘤等病變。
總之，肌肉組織做活檢在光鏡下能夠看到細胞的形態改變和組織結構的改變，醫生經過綜合分析可給出病理診斷。