形成肝內鈣化灶的病變很多,包括:①肝內膽管結石,是最常見的因素;②肝內慢性炎癥或創傷;③寄生蟲感染;④肝臟良惡性腫瘤和肝內轉移瘤鈣化;⑤先天發育形成,子宮內的胎兒有肝內鈣化灶形成,常合并先天畸形,發現率為0.057%。