肝硬化的臨床表現可分兩期，即肝功能代償期及肝功能失代償期，有的可長期停留在代償期，不一定進入失代償期。
肝功能代償期
是肝硬化的早期，癥狀較輕。常見食欲不振、乏力、惡心嘔吐、腹脹、上腹部不適或隱痛，大便正常或稀便等癥狀。面色萎黃，在面、頸、上胸、背部、兩肩及上肢可見蜘蛛痣或毛細血管擴張。有肝掌、肝臟輕度腫大、表面光滑、質地偏硬、可有輕度壓痛，脾臟輕度至中度腫大，肝功能檢查在正常范圍或輕度異常。
肝功能失代償期
出現肝功能減退的臨床表現，如消瘦、乏力、不規則低熱，面色黝黑灰暗、色素沉著及貧血。有各種消化道癥狀如惡心、嘔吐、稀便、腹脹等癥狀及鼻、齒齦、胃腸道等出血及紫癜。輕度至中度黃疸，男性病人有性欲減退、睪丸萎縮、毛發脫落、乳房發育；女性患者有閉經、不孕。同時有門脈高壓的表現，脾大，伴有白細胞、紅細胞及血小板計數減少，食管下段和胃底靜脈曲張，常因破裂出現嘔血、黑便及休克，腹壁和臍周靜脈曲張，痔核形成破裂時引起便血。腹水是肝硬化最突出的表現。
肝臟大小不一，一般是先大后小，質地較硬，呈結節狀，有時有壓痛。約半數以上病人血清膽紅素含量輕度增高，總膽固醇特別是膽固醇常低于正常，清蛋白降低，球蛋白增高，清蛋白/球蛋白比例降低或倒置，蛋白質電泳中γ-球蛋白顯著升高，硫酸鋅濁度試濁度試驗多呈陽性，BSP滯留常超過10%，SGPT顯著升高，凝血酶原時原時間延長，血免疫球蛋白IgG、IgA、IgM均增加，以IgG為最顯著。HBsAg可呈陽性反應，部分患者血清自身抗體反應陽性。
肝硬化繼發腎損害
肝硬化繼發腎損害時患者可發生肝硬化性腎小球腎炎和腎小管酸中毒，早期患者往往無明顯臨床癥狀，僅有少量蛋白尿。肝硬化繼發IgA腎病患者腎功能惡化轉為緩慢，呈良性過程。部分病人有系膜細胞、內皮細胞和（或）上皮細胞增殖，伴有系膜區及內皮下免疫復合物沉積，這些病人常有蛋白尿及血尿，也可出現水腫、高血壓及腎功能減退。
肝硬化繼發腎小管酸中毒的臨床表現與非肝病者相似。絕大多數為不完全性遠端腎小管酸中毒，少數病人有多尿、多飲、夜尿、尿濃縮不良及低血鉀、肌無力等表現。病人多有嚴重肝病癥狀和體征，同時也有持續性堿性尿、高鈣尿、低枸櫞酸尿，可合并尿路結石及繼發性甲狀旁腺功能亢進等。肝病性腎小管酸中毒時除腎臟排泌H 的能力減低外，還常伴有明顯的低鉀血癥。此外，由于腎臟排泄氨的能力降低，故可誘發或加重肝性腦病。