FLC應與普通型的肝細胞肝癌(表1)肝局灶性結節性增生、肝腺瘤及轉移性肝癌相鑒別。
肝臟局灶性結節性增生診斷較困難但影像學檢查可幫助與FLC鑒別。局灶性結節性增生的超聲CT均可發現肝占位,但核素顯像提示攝取過度或正常攝取,而FLC則為放射性缺損。肝腺瘤主要見于有口服避孕藥史的育齡婦女99mTc-PMT延遲顯像提示肝腺瘤呈強陽性病理檢查可作出明確診斷。但FLC的鑒別診斷有時較困難。尚須借助電鏡和組織化學染色來進一步明確診斷。繼發性肝癌有原發癌病史或證據.超聲圖像上主要表現為多個類圓