細菌培養分離
提高大便培養陽性率就能提高確診率，影響培養的因素，主要是大便性狀、病程及培養基的選擇。血性便、病程短者，陽性率高；水樣便、病程長，尤其超過7天者，陽性率低。山梨醇-麥康凱瓊脂（SMAC）可提高陽性率。
免疫學檢測
用單克隆抗體進行直接ELISA反應檢測O157∶H7大腸埃希桿菌。
基因檢測
應用EHEC特異性DNA探針，其敏感性、特異性均可達99%；或應用PCR對EHEC DNA序列分析，發現其溶血素AB基因為EHEC特有，其特異性強，敏感快速，3～4h可出結果。其他尚有對SLT1、SLT2兩對寡核苷酸引物同時擴增的多重PCR法，但尚未在臨床廣泛應用。基因檢測可用于臨床研究與流行病學調查。