鑒別診斷要考慮慢性或急性闌尾炎。根據人們治療的腸系膜淋巴結結核患兒，曾被誤診為闌尾炎者最多，甚至誤診達2～3年之久。其次為肝炎、非特異性腸系膜淋巴結炎、包蟲病、蛔蟲病等。此外，偶需鑒別者尚有胃及十二指腸潰瘍、膽囊炎腹部淋巴結腫塊，應與局限性回腸炎、淋巴肉瘤及其他腹部腫瘤相鑒別。
