1. G-M 雙糖單位；
2. 四肽尾
組成：革蘭氏陽性菌（如葡萄球菌）為 L-Ala + D-Glu + L-Lys + D-Ala ，革蘭氏陰性菌（如大腸埃希菌）為 L-Ala + D-Glu + m-DAP + D-Ala ；
連接方式：四肽中M端的L-Ala上α-NH2與M中乳酸的羧基連接；
3. 肽橋
組成：肽橋的變化甚多，已超過100種，如，在S.aureus中，肽橋為甘氨酸五肽。
肽聚糖
連接方式：甘氨酸五肽的N端α-氨基與四肽C端D-Ala上的羧基連接，C端羧基與另一個四
肽上L-Lys的ε-氨基連接。革蘭氏陰性菌無特殊肽橋，故前后兩肽尾的D-Ala與m-DAP直接相連。
溶菌酶、抗生素能抑制肽聚糖的生物合成。肽聚糖合成的條件：需要兩個主要的載體，即尿嘧啶二磷酸（Uridine Diphosphate，UDP）和聚戊二烯磷酸酯（又稱細菌萜醇）。