腎皮質膿腫主要（90％）是由金黃色葡萄球菌從遠處感染灶（常為皮膚感染）經血行播散 引起。常見誘因有靜脈注射、糖尿病和血液透析。上行感染很少引起腎皮質膿腫。開始形成小膿腫隨后逐漸擴大并融合成充滿膿液的厚壁炎性腫塊。最后可穿破腎被膜形成腎周膿腫。大多數腎皮質膿腫累及單側（97％），并好發于右側（63％）。
