1.營養不良 小胃綜合征，進食后不適使病人長期處于半饑餓狀態，傾倒綜合征和胃腸道吸收不良使病人消瘦和營養不良。
2.貧血 由于術后胃酸減少，影響鐵質的吸收，導致缺鐵性貧血，由于胃切除后抗貧血內因子缺乏，造成維生素B12吸收障礙，導致巨幼紅細胞性貧血。
3.腹瀉 多因畢Ⅱ式吻合后胃排空過快，小腸蠕動增強，消化與吸收不良所致，另外食物和膽汁，胰液不能很好地混合，喪失了胰液分解脂肪和膽鹽的乳化脂肪作用，影響脂肪吸收，導致脂肪瀉。
4.骨病 發生在術后5～10年后，以骨質軟化為多見，嚴重者可致骨質疏松，主要癥狀有骨骼疼痛，下肢無力，容易骨折等，畢Ⅱ式術后食物不再經過十二指腸，鈣吸收減少，脂肪吸收不良也影響脂溶性維生素D的吸收。
為了排除胰腺功能不足，輸入襻綜合征，胃空腸結腸瘺，胃回腸錯位吻合等特殊原因引起的吸收不良，除了常規血化驗檢測外，應作上消化道鋇餐，鋇灌腸及消化道內鏡檢查。