1.慢性肝膽疾病 如慢性肝炎，肝硬化及肝內外膽管梗阻等，可因膽鹽的缺乏，使脂肪不能乳化及轉運，故可導致脂肪瀉。
2.小腸疾病 小腸切除過多(如小腸被切除全長的75%以上或僅剩余120cm時，稱為短腸綜合征)，胃，結腸瘺或胃，回腸瘺都可因小腸的吸收面積減少，或食物不經過小腸或空腸而經瘺管直達結腸，最終均可導致腹瀉。
