1.典型表現 消化性潰瘍主要癥狀為上腹疼痛或消化不良。疼痛位于上腹部中線偏右部位較為局限。患者常常將疼痛描述為“咬蝕樣”(gnawing)或“饑餓樣”。疼痛具有明顯的節律性可因進食食物或服用抗酸藥而緩解，常在餐后1～3h(飲食刺激胃酸持續分泌3～4h而食物完全從胃排空約2h)再發患者常在凌晨1:00～3:00點于睡眠中疼醒，尤其是對那些睡前吃零食者。疼痛可向右季肋區或右背部放射，若無合并癥很少發生放射性疼痛。持續的后背痛常預示后壁潰瘍的穿透。潰瘍病疼痛的另一個主要特點是它的周期性，即間隔數周到數月常可復發加重期腹痛常每天發作，持續數周后緩解，直至下一次復發。
發病多在秋末春初。由于進食常可緩解疼痛，十二指腸患者常喜歡吃零食，其體重常略高于正常人十二指腸潰瘍患者，如腹痛明顯加劇并擴散至全腹部健康搜索，常提示潰瘍已經穿孔常隨之很快出現腸鳴音消失及大面積的反跳痛同樣，疼痛失去正常的節律而轉變為持續性疼痛常提示穿透可能。
某些慢性十二指腸潰瘍患者，可出現“口腔內涌水癥狀”(water-brash)，即口腔內突然充滿清亮、無色無味的液體(如唾液)。這與胃食管反流導致的胃內容物流入口腔不同(胃內容物有色且有酸苦味)，不應將兩者混淆。胃食管反流癥狀如反酸、燒心等在潰瘍病患者中并不少見健康搜索尤其見于那些合并不同程度胃排空障礙的患者。不過，燒心乃是胃食管反流的表現而非十二指腸潰瘍的表現鶒體格檢查一般無異常發現健康搜索在急性潰瘍發作期，可出現上腹部輕壓痛健康搜索，壓痛點常位于上腹正中偏右2.5cm或更多。檢查大便潛血是必要的，如發現潛血，應進一步檢查，不宜延遲。
2.非典型表現 十二指腸潰瘍患者中非典型病例十分常見。事實上，“典型表現”僅見于少數病例，而非衡量的尺度。因此，單純依靠病史和體格檢查來診斷或鑒別十二指腸潰瘍并不可靠。許多患者沒有明確的腹痛或疼痛定位模糊患者可完全沒癥狀或僅主訴“消化不良”或隱隱的消化不良癥狀。這些癥狀非常不特異，很大部分并非潰瘍所致。不足1%的十二指腸球部潰瘍及稍高比例的球后及空腸潰瘍的發病與潛在的高胃酸分泌狀態有關，例如Zollinger-Ellison綜合征、胃竇曠置綜合征、系統性肥大細胞貯積癥、粒細胞性白血病甲狀旁腺功能亢進或小腸切除術后。臨床提示可能存在這種病變的表現有：腹瀉體重下降、胃內pH持續接近1.0。有明確的高胃酸表現而無其他癥狀時，還需測定空腹血清胃泌素及血鈣輔助診斷這些檢查在臨床實踐中用得很少，且如果沒有對胃酸分泌進行仔細研究，常很難作出解釋。