神經調節：胃蛋白酶原的分泌受到神經調節的影響。交感神經興奮時，能夠抑制胃蛋白酶原的分泌；而副交感神經興奮時，則能夠促進胃蛋白酶原的分泌。
激素調節：胃蛋白酶原的分泌也受到激素的調節。例如，胰島素能夠促進胃蛋白酶原的分泌，而胰高血糖素則能夠抑制胃蛋白酶原的分泌。
飲食調節：飲食中的蛋白質含量也能夠影響胃蛋白酶原的分泌。當飲食中蛋白質含量較高時，胃蛋白酶原的分泌會增加；而當飲食中蛋白質含量較低時，胃蛋白酶原的分泌會減少。
胃黏膜細胞自身調節：胃黏膜細胞自身也能夠調節胃蛋白酶原的分泌。當胃黏膜細胞受到刺激時，會釋放一些物質來促進胃蛋白酶原的分泌；而當胃黏膜細胞受到抑制時，則會減少胃蛋白酶原的分泌。