胚胎干細胞（Embryonic stem cells,ES細胞或ESCs）是來源于囊胚內細胞團的多能干細胞，而囊胚是胚胎植入前早期的一個階段。
人類胚胎在受精后4-5天到達囊胚期，此時的胚胎由50-150個細胞組成。分離胚結或內細胞團（ICM）會導致囊胚的破壞，這一過程會引發倫理問題，包括植入前階段的胚胎是否應具有與植入后發育階段的胚胎相同的道德考慮。
研究人員目前非常關注胚胎干細胞的治療潛力，因為臨床應用是許多實驗室的目標。[5]潛在用途包括治療糖尿病和心臟病。
這些細胞正被研究用于臨床治療、遺傳疾病模型和細胞/脫氧核糖核酸（DNA）修復。然而，研究和臨床過程中的副作用，如腫瘤和免疫排斥反應也有報道。