胰腺假性囊腫的臨床表現特點主要是根據急性或慢性胰腺炎所處的階段。急性囊腫時，表現為病情鶒的延續病人處于急性胰腺炎的情況下而不能很快好轉，發熱、上腹部脹痛和壓痛腫塊腹脹、胃腸道功能障礙等；嚴重的可出現多種并發癥后期的病例，假性囊腫壁已經成熟，周圍的炎癥改變已經消退，此時臨床診斷的要點包括：①急性胰腺炎發作的病史；②上腹部疼痛不適及胃腸功能障礙；③上腹部腫物；④尿淀粉酶可升高或不升高。
慢性胰腺假性囊腫多發生在慢性復發性胰腺炎的基礎上，當囊腫體積不很大，特別是位于胰腺尾部時，臨床上捫不到上腹部腫塊，主要表現為慢性胰腺炎的癥狀，如上腹部及腰背部痛脂肪消化功能障礙、糖尿病等。上腹痛、慢性胰腺炎、脾大、上消化道出血肝功能正常是此癥的特征。