膠原酶分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ型以及肝細胞專用膠原酶，要根據所要分離消化的組織類型選擇膠原酶類型。
1、膠原酶Ⅰ用于上皮、肺，脂肪和腎上腺組織細胞的分離。用于消化組織中連接部分使其成為單個細 胞，用于哺乳動細胞的分離。
2、膠原酶Ⅳ包含至少7種蛋白酶成分，分子量從68-130KD不等。它能消化多種組織。
3、膠原酶Ⅴ包含至少7種蛋白酶成分，分子量從68-130KD不等。它可用于胰腺小島組織的分離，將結締組織分離成單個細胞。
4、膠原酶Ⅱ適用于肝臟，骨，甲狀腺，心臟和唾液腺組織。
