昏迷時程較長的重度原發腦干傷，要盡早行氣管切開、呼吸機輔助呼吸及亞低溫治療。對于輕度腦干損傷的病人，可按腦挫裂傷治療，部分患者可獲得良好療效，而對于重者，其死亡率很高，所以救治工作應仔細認真，要有長期的打算，且護理工作顯得尤為重要，同時，密切注意防治各種并發癥。
1.保護中樞神經系統，酌情采用冬眠療法，降低腦代謝；積極抗腦水腫；使用激素及神經營養藥物。
2.全身支持療法，維持營養，預防和糾正水，電解質紊亂。
3.積極預防和處理并發癥，最常見的是肺部感染、尿路感染和褥瘡。加強護理，嚴密觀察，早期發現，及時治療，對于意識障礙嚴重、呼吸功能紊亂的病人，早期實施氣管切開至為必要，但氣管切開后應加強護理，減少感染機會
4.對于繼發性腦干損傷應盡早明確診斷，及時去除病因。若拖延過久，則療效不佳。
5.恢復期應著重于腦干功能的改善，可用蘇醒藥物，高壓氧艙治療，增強機體抵抗力和防治并發癥。