原發性腦干損傷與其他的顱腦損傷往往同時存在臨床癥狀重疊,鑒別診斷較為困難。對于傷后立即昏迷并進行性加重,瞳孔大小多變、早期發生呼吸循環功能衰竭、出現去皮質強直及雙側病理征陽性的病人,原發性腦干損傷的診斷基本成立。