分解糖類產酸不產氣。氧化酶試驗陽性。腦膜炎奈瑟菌可產生自溶酶，人工培養時若不及時移種，數日后菌體自溶。
抗原構造及分類
1．莢膜多糖抗原（capsular polysaccharides antigen） 具有群特異性。根據此抗原性不同，可將腦膜炎奈瑟菌分為至少13個血清群。與人類疾病關系密切的主要是A、B、C、Y及W-135群。A群及C群是引起腦膜炎流行的主要血清群。
2．外膜蛋白（outer membrane protein） 具有型特異性。根據外膜蛋白不同將腦膜炎奈瑟菌分為20個血清型。2型和15型與流行性腦脊髓膜炎有關。外膜蛋白的功能是在細菌細胞壁上形成孔隙，有利于營養物質進入細胞內。
3．脂多糖抗原（lipopolysaccharide antigen， LPS） 此抗原與大腸桿菌有共同抗原存在。脂多糖是腦膜炎奈瑟菌的主要致病物質。