本病患者幾乎總有血尿，包括鏡下或者肉眼血尿。蛋白尿可以比較輕微，約有30%表現為無癥狀性蛋白尿，但半數患者尿蛋白>3.5g/24h，90%以上患者蛋白尿選擇性差。尿FDP和C3可升高。實驗室檢查的一個特征性改變就是血補體的降低。約有75%的本病患者C3持續性降低，其中Ⅱ型病變中較常見，占80%～90%，約10%的患者顯著下降到低于20～30mg/dl。在Ⅰ型病變中，平均C3濃度降至正常的68%，在Ⅱ型降為正常的47%，而且Ⅱ型比Ⅰ型持續時間更長。早期起作用的補體成分(如C1q、CA)，在Ⅰ型病變中有不同程度的下降，而在Ⅱ型中通常正常或者輕度下降，但Ⅱ型常伴有晚期起作用的補體成分C5b-9的下降。在沒有任何病情變化或治療的情況下，血清C3水平可有波動，并有可能隨時間的推移有恢復正常的傾向，說明補體的變化與病情及治療無相應的關系。繼發于狼瘡性腎炎、晚期肝病、單克隆球蛋白病、白血病和轉移癌的腎病綜合征可以出現C3下降，但是其他原發性腎病綜合征，除鏈球菌感染后腎炎外，少見C3降低，因此持續的補體降低對于該病的診斷有很大的提示作用。與本病不同，鏈球菌感染后腎小球腎炎的C3水平常下降，但在6～8周多特征性地恢復到正常水平。毛細血管性腎小球腎炎腎病綜合征時補體持續降低，多大于2個月。C3的低下，是補體途徑激活和合成減少的結果。C3降低而經典途徑C1q和C4一般正常，表明替代途徑可能被激活。但是，繼發于冷球蛋白血癥的系膜毛細血管性腎小球腎炎，C4的降低比C3更顯著。本組疾病患者血中存在一種熱穩定因子，又稱C3腎炎因子(C3NF)這是一種對自身C3轉化酶的抗體。Ⅱ型中60%以上檢測有C3NF陽性，Ⅰ型僅有10%～20%呈陽性，可能是引起這些患者持續低C3血癥的原因之一。C3NF及其類似物，還可見于其他與腎炎相關的腎小球疾病。其他一些降解C3的因子在急性腎炎尤其是狼瘡性腎炎中可以檢測到。血清備解素水平通常正常，如果C3水平下降，則備解素水平也可輕度下降。B因子的血清水平通常正常或稍下降。循環免疫復合物及冷球蛋白可呈陽性。75%以上的Ⅰ型有特殊B細胞同種抗原，提示有易感性的遺傳基礎。HLA-AB7和家族性BIH缺陷與Ⅱ型疾病相關。臨床上部分患者可有氮質血癥，這往往提示急性腎炎綜合征。腎小球濾過率常降低，但也可正常，甚至腎活檢顯示腎小球嚴重損害，GFR有時也會正常。常伴有水鈉潴留，導致高血壓。半數以上患者可有正細胞正色素性貧血，貧血可以很嚴重，其嚴重程度與氮質血癥不成比例。紅細胞和血小板壽命可以縮短。40%～60%患者的抗鏈球菌抗體滴度增高。