膜蛋白是膜功能的主要體現眷。根據與膜脂的結合方式以及在膜中的位置的不同，膜蛋白分為：整合蛋白（integralprotein）、外周蛋白（peripheralprotein）脂錨定蛋白（1ipid—anchoredprotein）。
整合蛋白（IntegraIProteins）：部分或全部鑲嵌在細胞膜中或內外兩側的蛋白質；根據跨膜次數將跨膜蛋白分為單次跨膜、多次跨膜、多亞單位跨膜等；整合蛋白約占膜蛋白的70一80%。整合蛋白與膜結合非常緊密，只有用去垢劑（detergent）才能從膜上洗滌下來．常用SDS和Triton—X100。
外周蛋白又稱為外在蛋白（extrinsicprotein），為水溶性的，分布在細胞膜的表面．靠離子鍵或其他較弱的鍵與膜表面的蛋白質分子或脂分子的親水部分結合，因此只要改變溶液的離子強度甚至提高溫度就可以從膜上分離下來。
脂錨定蛋白（Lipid—anchoredproteins）：又稱脂連接蛋白（1ipid—Iinke（1proteins）．同脂的結合有兩種方式：一種方式是通過一個糖分子間接同脂雙層中的脂結合；一種是蛋白質直接與脂雙層中的脂結合。脂錨定蛋白通過磷脂或脂肪酸錨定，共價結合。分兩類．一類是糖磷脂酰肌醇（GPl）連接的蛋白，GPl位于細胞膜的外小葉．用磷脂酶C處理能釋放出結合的蛋白。許多細胞表面的受體、酶、細胞粘附分子和引起羊瘙癢病的PrPC就是這類蛋白。另一類脂錨定蛋白與插入質膜內小葉的長哦氫鏈結合。