自身免疫性肝硬化在臨床上常表現為乏力、黃疸、肝脾腫大、皮膚瘙癢和體重下降不明顯等癥狀。病情發展至肝硬化后，可出現腹水、肝性腦病、食管靜脈曲張出血。自身免疫性肝炎病人還常伴有肝外系統免疫性疾病，最常見為甲狀腺炎、潰瘍性結腸炎等。實驗室檢查以γ球蛋白升高最為顯著，以igg為主，一般為正常值的2倍以上。肝功能檢測血清膽紅素、谷草轉氨酶、谷丙轉氨酶、堿性磷酸酶均可升高，血清白蛋白、膽固醇酯降低，反映了自身免疫性肝炎以肝細胞損害為主的特征。
中醫在臨床研究中發現，這部分病人主要表現乏力、納差、腹脹、兩脅不適、尿色深黃，兼有低熱、口干咽燥、頭暈目澀、失眠多夢、腰膝酸軟、大便干燥，女性患者可有月經不調。查體可見面色晦暗、脾臟增大，舌質暗紅或有瘀斑。中醫辨證多屬氣陰兩虛、瘀血阻滯、濕熱內蘊。