當色譜分析儀出現故障時，不能準確分析出天然氣組分、密度、發熱量、壓縮因子等物性參數，這些物性參數不準確將影響超聲波流量計算機對流量的修正，從而影響流量累計量的準確性，色譜分析儀也是計算聲速的一個指標，如果計算聲速與各聲道平均聲速誤差超過0.2%時，查找誤差較大原因。
解決方案：當出現色譜故障時，初步判斷故障原因，如果是硬件故障，及時報修，進行更換；如果不是硬件故障，將色譜分析值與上下游最近站場組分進行對比，查找組分偏差原因，對其進行維修。按照檢定標準定期對色譜分析儀進行檢定。
