色譜分析是儀器分析領域中發展迅速，研究和應用十分活躍的領域之一。由于色譜分析可以連續對樣品進行濃縮、分離、提純及測定，使其成為每一個分析工作者普遍采用的分析、檢測手段，并已廣泛應用于石油、化工、食品、醫藥、衛生、冶金、地質、農業、環境保護等各個行業中，可以說只要有分析任務的地方都在使用色譜分析法。近二三十年來發展的氣相色譜一質譜(GC-MS)聯用技術、離子色譜(IC)、超臨界流體色譜(SFC)、毛細管區帶電泳(CZE)等技術使色譜分析領域更是充滿了活力。尤其是毛細管電泳技術，具有分離效率高(柱效達100萬以上理論塔板數/m)，樣品用量小(10-6～10-9 mL)、靈敏度高(檢出限低至10-15～10-20 mol·L-1)，分離速度快(小于10 min)等特點，適用于離子型大分子，如氨基酸、核酸、肽及蛋白質的分析，甚至細胞和病毒等的快速、高效測定，在生物分析及生命科學領域中有極為廣闊的應用前景。
在農業上，氣相色譜法可以對農藥殘留量、氨基酸、維生素、激素、糖類、脂質、核酸等進行測定，也可對某些金屬離子以及大氣中的CO2，SO2，H2S，甲烷等進行分析。高效液相色譜法可對維生素、生物堿、激素、氨基酸、農藥、核酸、香豆素、脂質等有機物質進行分析，也可測定一些無機離子及金屬元素。離子色譜法是一種分析無機和有機離子的液相色譜技術，能測定數百種陰、陽離子和化合物，最適合多組分與多元素的同時分析。該方法選擇性好，樣品用量少，靈敏度高，易實現自動化，是分析水中陰離子的最好方法，多應用于環境水樣的測定。