色譜柱是色譜儀最重要的部件（心臟）。通常用厚壁玻璃管或內壁拋光的不銹鋼管制作的，對于一些有腐蝕性的樣品且要求耐高壓時，可用銅管、鋁管或聚四氟乙烯管。柱子內徑一般為1～6 mm。常用的標準柱型是內徑為4.6 或3.9mm ，長度為15 ～30cm 的直形不銹鋼柱。填料顆粒度5 ～10μm ，柱效以理論塔板數計大約 7000 ～10000。
發展趨勢是減小填料粒度和柱徑以提高柱效。
