除非特殊說明，在所有情況下，所用溶劑的體積應該是色譜柱體積的40～60倍。
應在清洗過程開始和結束時各測一次柱效和容量因子等，比較色譜柱性能的改善，以確定清洗的效果。
確保色譜柱中沒有樣品和緩沖溶液，清洗前所用的溶劑應與最初清洗時所用的溶劑相溶。
應確保實驗測試時所用的流動相與色譜柱中最后的溶劑相溶。
