單環芳香烴
苯的降解
苯的降解在 30 年前的研究已經非常成功 。苯降解時有二個分支途徑，途徑如圖1中a。苯環最初被苯雙加氧酶攻擊而形成鄰苯二酚，鄰苯二酚進一步通過間位或鄰位雙加氧酶的作用而產生粘康酸半醛或粘康酸。
取代苯的降解
取代基團的存在使苯環的降解出現兩種可能：先降解苯環或先降解側鏈 。含 2 ～ 7 個碳原子的單烴基取代苯的一般途徑如圖1中b)。當 C >7 時，先通過 β，ω氧化降解取代烴基鏈，最后再降解苯環。長的烴基側鏈氧化后足夠給微生物提供生長的能量，這樣微生物就不會降解苯環 。
聯苯的降解
生物降解聯苯途徑如圖1中c，加氧聯苯降解有兩條途徑：1，2 位加氧和 3， 4 位加氧，以前者居多，聯苯經過兩步雙加氧酶作用后形成 2—經基—6 —酮基—6 —苯基 —2，3 —己二烯酸(HOPDA)，再進一步被降解成苯甲酸(BA)。聯苯和低度取代聯苯還可以進行微生物降解, 降解的產物為單經基和二經基化合物。
多環芳烴
多環芳烴(Polycyclic Aromatic Hydrocarbons，PAH)是有機物不徹底燃燒產生的一類含有兩個或兩個以上融合芳香環的化合物 。微生物降解蔡的途徑如圖1中d。與其它芳香化合物的降解相同，第一步中雙加氧菌進攻環形成 1，2 —經基蔡， 隨后在第 1 和第 9 個碳原子間斷裂 。 [4]
加氧酶
苯環化合物因其具有苯環結構而較難分解，若要在常溫常壓下將其分解，就必須依賴酶的參與。參與苯環化合物代謝的氧化酶可分為兩類：一類為苯環羥基化加氧酶；另一類為苯環切割化加氧酶¨3'Hj。苯環羥基化加氧酶是通過氧分子及NADH或NADPH提供電子在苯環上加上兩個羥基，如甲苯經過甲苯雙加氧酶催化與氧分子形成順
甲苯二氫二醇。苯環切割化加氧酶是由氧分子將苯環氧化并進行開環，如鄰苯二酚在氧分子與酶的作用下，形成粘康酸或粘康酸半醛。最早的苯環羥基化加氧酶是由Gibson等從惡臭假單胞菌Fl中分離出來的，所有的酶都屬于復合酶體系，并由2至3種蛋白質組成，但是在亞基的組成上卻有相當大的差別。Batie等將其分為3大類：ClassI、ClassⅡ及ClassUl。Clam是由2種成分組成的，而ClasslI及ClassHI都是由3種成分組成的。苯環切割化加氧酶在進行開環反應時可分為兩種形式：一種為在雙氫氧基內切割，亦可稱為鄰位切割；另一種為在雙氫氧基外切割，亦可稱為間位切割。