當一個熒光分子(又稱為供體分子)的熒光光譜與另一個熒光分子(又稱為受體分子) 的激發光譜相重疊時, 供體熒光分子的激發能誘發受體分子發出熒光, 同時供體熒光分子自身的熒光強度衰減。FRET 程度與供、受體分子的空間距離緊密相關, 一般為7~10 nm 時即可發生FRET; 隨著距離延長, FRET呈顯著減弱。
供體和受體之間FRET的效率,可以由E=1/1+(R/R0)exp6反映,其中R表示供體和受體之間的距離,R0表示福氏半徑,依賴供體發射譜和受體激發譜的重疊程度,以及供體和受體能量轉移的偶極子的相對方位。