基線：是指擴增曲線的水平部分。是指在PCR擴增反應的最初數個循環里，熒光信號變化不大。接近一條直線，這樣的直線即是基線。每個樣品孔都設置獨立基線。
閾值：是一個熒光強度值，熒光域值必須設定在 PCR擴增的指數期。
閾值線：穿過閾值與X軸平行的直線稱為閾值線；
Ct值：是閾值線與擴增曲線的交點對應在X軸上的值，是循環數。
