藥物治療對肢體動脈狹窄所引起的缺血癥狀遠不如對冠心病心絞痛有效，特別是血管擴張劑，臨床上已證明對缺血性肢痛無效。肢體動脈狹窄時，在運動狀態下，其狹窄的遠端血管擴張而使組織的灌注壓下降，而因肌肉運動所產生的組織間的壓力甚至可超過灌注壓。此時使用血管擴張劑將加劇這種矛盾，除非血管擴張劑可以促進側支循環，否則不能使運動肌肉的灌注得到改善。換言之，缺血癥狀不可能緩解。有些臨床試驗證實服用己酮可可堿可增加間歇性跛行患者的運動耐受量，但甚為得到公認。對于嚴重肢體缺血的患者，長期用依前列醇（前列腺素I2）靜脈給藥，可減輕疼痛并有利于缺血性潰瘍的愈合。
抗血小板藥特別是阿司匹林對防止四肢動脈閉塞性病變的進展有效，但不能提高患者的運動耐受能力。噻氯匹定也可抑制血小板聚集。抗凝藥肝素和華法林對慢性肢體動脈粥樣硬化無效。同樣，尿激酶、鏈激酶等也只能對急性血栓性血管閉塞無效。