工業生產低聚果糖方法主要有兩種:一是以菊芋為原料提取菊粉,再經酶水解而得。第二種方法是以蔗糖為原料,采用固定化酶法進行連續反應,將高濃度蔗糖溶液在50℃~60℃下以一定速率流過固定化酶柱,利用β-果糖轉移酶進行一系列轉移反應而獲得低聚果糖。該法連續性好、自動化程度高,操作穩定性好,酶能反復使用,利用率高。