1．球狀蛋白質分子形狀接近球形，水溶性較好，種類很多，可行使多種多樣的生物學功能。
2．纖維狀蛋白質分子外形呈棒狀或纖維狀，大多數不溶于水，是生物體重要的結構成分，或對生物體起保護作用。
3．膜蛋白質一般折疊成近球形，插入生物膜，也有一些通過非共價鍵或共價鍵結合在生物膜的表面。生物膜的多數功能是通過膜蛋白實現的。
