蛋白質作為功能的直接行使者，已經被科研工作這廣泛應用于不同領域中，目前蛋白組學有很多優秀的科研成果，在各個領域及期刊上發表，其中也不乏CNS在內的頂級期刊。那我們的蛋白組學文章可以投哪些期刊呢？了解已發表文章的情況可以幫助我們很好的解決這個問題。這里，我們以“Proteomics”為關鍵詞，共搜索到155,429篇文章，隨機選取了2017-2021年共60,474篇文章中的10,000篇，針對蛋白組學進行整體分析（第1,2,4節）；同時，以“Proteomics”及各領域關鍵詞聯合搜索，對不同研究領域進行分析（第3節）。最終獲取蛋白組領域的系統信息，希望對蛋白組學文章投稿有所助益。（本文分析基于從總體中隨機抽取的一定數量文章，因此內容僅供參考）
1. 文章概述
首先對搜索到的文章進行時間維度的統計，從近10年來看，蛋白組學文章發文數量呈逐漸增加的趨勢，整體上研究仍然火熱。
圖1 近10年蛋白組學文章發表數
接著以2017-2021近5年數據為基礎，隨機提取其中的10000篇文章，對蛋白組學發文期刊進行統計。發表文章數量大于50篇的期刊共23個，總計3695篇文章，平均IF=5.43，中位IF=4.379。發表最多的期刊是JPR (Journal of Proteome research)，MMB（Methods in Molecular Biology），JP (Journal of Proteomics)，Proteomics，MCP (Molecular & Cellular Proteomics)等，排名前幾的期刊基本都是蛋白領域主流雜志，但相對而言影響因子大都不是很高。
圖2 發表50篇以上蛋白組學文章的期刊
2. 文章發表期刊IF區間分布
在提取的10000篇文章中，對發文數目大于等于20篇的期刊IF區間進行統計，可以看到，整體上影響因子主要還是集中在0-5分，占57.97%，其次為5-10分，占比34.46%，10分以上多為一些綜合期刊。
圖3 文章發表期刊IF區間
3. 部分研究領域蛋白組學文章發表情況
以“cancer”為癌癥關鍵詞，對2017-2021年發表的蛋白組學文章進行查詢，共查詢到14903篇文章，不同年份發表情況整體上穩定增加。
圖4 2017-2021癌癥相關蛋白組學文章發表數
對發文量前20的期刊進行統計，排名靠前的仍以蛋白組學主流期刊以及組學綜合期刊為主，平均影響因子IF=7.632，中位IF=6.281。
圖5 2017-2021癌癥相關蛋白組學文章發表數前20期刊
以“Diabetes”為糖尿病關鍵詞，對2017-2021年發表的蛋白組學文章進行查詢，共查詢到2211篇文章，不同年份發表情況整體上逐年增加，2020年有較大增長。
圖6 2017-2021糖尿病相關蛋白組學文章發表數
對發文量前20的期刊進行統計，以蛋白組學主流期刊，綜合期刊，以及糖尿病領域期刊為主，平均影響因子IF=7.349，中位IF=5.501。
圖7 2017-2021糖尿病相關蛋白組學文章發表數前20期刊
以“cardiovascular diseases”為心血管疾病關鍵詞，對2017-2021年發表的蛋白組學文章進行查詢，共查詢到2565篇文章，2017-2021年間發文數量相差不大，基本在400篇以上。
圖8 2017-2021心血管疾病相關蛋白組學文章發表數
對發文量前20的期刊進行統計，期刊以蛋白組學主流期刊，心血管主流期刊，綜合期刊為主，同時含Circulation research，JACC等心血管領域頂級期刊，平均影響因子IF=9.213，中位IF=5.406。
圖9 2017-2021心血管疾病相關蛋白組學文章發表數前20期刊
以“plant”為植物關鍵詞，對2017-2021年發表的文章進行查詢，共查詢到6454篇文章，不同年份發表情況整體上也逐年增加。
圖10 2017-2021植物相關蛋白組學文章發表數
對發文量前20的期刊進行統計，以蛋白質組學主流期刊，植物領域期刊為主，平均影響因子IF=5.416，中位IF=4.845。
圖11 2017-2021植物相關蛋白組學文章發表數前20期刊
4. 不同IF區間期刊
2017-2021年近5年提取的10000篇文章中，發表蛋白組文章數大于等于20篇的期刊IF區間統計詳細列表可以參照下表，參照雜志影響因子及發文數目，可以對投稿提供很好的參考價值。
5. 投稿建議及評述
目前蛋白質組學領域主流的雜志 MCP (Molecular & Cellular Proteomics)，JPR (Journal of Proteome research)，JP (Journal of Proteomics)，Proteomics等對于大規模蛋白質組學數據的嚴謹性都有非常高的要求，并且都要求在正文或者補充數據中寫明實驗設計以及數據分析的細節。而新穎的選題，嚴謹的實驗設計以及更全面的分子機制和功能驗證等都是蛋白組學研究發文的關鍵因素，下面對一些具體的期刊分三檔進行一個簡單介紹。
1）第一檔期刊（影響因子10分以上）
組學期刊：Molecular Systems Biology，Nature Genetics等。
綜合性期刊：cell，Nature，Science，Nature Communications，PNAS，Molecular Cell，Cell Research等。
組學思路：在這類高水平期刊中，組學驅動的研究主要包括：
1.大隊列研究，篩選臨床生物標志物。
2. 組學+目的基因后續深入、完整的功能機制研究。
3.大樣本多組學或多樣本類型多組學，大數據分析。
2）第二檔期刊（影響因子5~10分）
組學期刊：Genomics Proteomics and Bioinformatics (GPB)，Molecular & Cellular Proteomics（MCP）等
綜合期刊：Cell Reports，Frontiers in Microbiology，mSystems，Scientific Data等。
組學思路：這類文章除了單純的組學數據分析外，比第三類期刊內容更豐富。通常要求大數據集，或數據分析完整性以及進一步功能驗證及機制研究。
3）第三檔期刊（影響因子5分以下）
組學期刊：BMC Genomics，Proteomics，Journal of Proteomics，Journal of Proteome Research等。
綜合期刊：PLoS One等。
組學思路：這類文章一般是最常見也是最簡單的組學研究思路。
1. 蛋白質組學方向：組學+差異蛋白WB或PRM驗證。
2.蛋白質翻譯后修飾組學方向：則以修飾組學數據分析為主。