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  • 發布時間:2020-09-01 12:35 原文鏈接: 蛋白質組樣品制備程序2

    2)在4℃條件下以20000g的離心力冷凍離心60分鐘 (離心力務必達到或大于20000g)。

    3)移取上清溶液。若上清樣品不立即使用,則須儲存于-80℃(最佳條件)或-20℃的無霜冰箱中以防止蛋白質的降解。

    2、用初始緩沖液(Start buffer)交換處理細胞裂解液

    1)在上述細胞裂解液中,加入初始緩沖液至最后體積為2.5mL,充分混合。

    2)用約25mL初始緩沖液平衡PD-10柱(編號:17-0851-01)。

    3)加入步驟第1)所獲得的2.5mL樣品到PD-10柱, 丟棄洗脫液。

    4)用初始緩沖液洗脫, 從PD-10柱中洗脫蛋白質,收集前3.5mL部分。

    5)所獲得的3.5mL樣品即可用于HPCF 1D柱的進樣分離分析。

    * 為檢驗所獲得樣品的優劣,可取50uL上述已經交換過的樣品進樣到HPRP 2D柱,觀察所有蛋白的反相洗脫色圖譜。在這一步,如果樣品制備有一些問題, 在分析色譜圖后將會鑒別出來。注意: 根據化合物和蛋白的量預測樣品, 在這時應該得到一張“豪豬”狀的色譜圖(a very "spikey or porcupine" liking chromatogram),使你分析的樣品有意義,如果沒有這樣的蛋白圖譜, 請停止進行色譜聚焦分離分析,繼續摸索樣品的制備方法。

    四、膜蛋白裂解方法步驟

    1、膜蛋白裂解緩沖液的組份及其終濃度

    尿素5M

    硫脲2M

    甘油10%

    Tris-HCl50mM (pH 7.8-8.2, 10-25℃)

    n-辛基葡糖苷2.0%

    SB3-10(N-decyl-N,N-dimethyl-3-ammonio-1-propane sulfonate) 2.5%(w/v)

    TCEP (Tris (2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride) 5 mM

    蛋白酶抑制劑 1.0mM

    2、10%甘油溶液(100mL)的配制

    1)量取1mL甘油到100mL的量筒;

    2)加蒸餾水至指定刻度(100mL)。

    3、31.45mM蛋白酶抑制劑溶液(母液)(10mL)的配置

    1) 在P/N P2714蛋白酶抑制劑中加入10.0 mL的水,混勻。

    2) 分裝到2mL的小瓶中,放置在-20℃保存備用。
    4、裂解緩沖液儲備液(50mL)的配制

    1)取10% 的甘油溶液20 mL 放在100 mL的燒杯中;

    2)加入Tris0.304 g (Fisher, Part Number: BP154-1),攪拌至完全溶解(50Mm);

    3)慢慢加入硫脲7.61 g (Sigma, Part Number: T7875, FW 76.12), 攪拌至完全溶解;



    4)慢慢加入15.02 g尿素(Sigma, Part Number: U0631, FW 60.06) , 攪拌至完全溶解;

    5)慢慢加入1.0 g n-辛基葡糖苷(Sigma, Part Number: O8001, FW 292.4), 攪拌至完全溶解;

    6)慢慢加入1.25 g SB3-10 (Sigma Part number: D4266, FW 307.5) , 攪拌至完全溶解;

    7)慢慢加入0.072 g TCEP (Sigma, Part Number: C4706, FW 286.7), 攪拌至完全溶解;

    8)加入31.45mM蛋白酶抑制劑溶液1.6mL, 攪拌至完全溶解;

    9)轉移到50mL的量杯中, 加10%甘油溶液至50mL容量;

    10)分裝到2.0 mL的小瓶中, 在-20℃中保存備用。

    5、膜蛋白裂解方法步驟

    1)取以上的裂解緩沖液2.0 mL懸浮細胞膜樣品, 充分振蕩混合。

    2)在4條件下離心力20000g下冷凍離心60分鐘(離心力務必大于或

    等于20000g)。

    3)移取上清液。若上清液樣品不立即使用,則須儲存于-80℃(最佳條件)或-20℃的無霜冰箱中以防止蛋白質的降解。

    6、用初始緩沖液(Start buffer)交換處理細胞裂解液

    1)在上述細胞裂解液中,加入初始緩沖液至最后體積為2.5mL,充分混合。

    2)用約25mL初始緩沖液平衡PD-10柱(編號:17-0851-01)。

    3)加入步驟第1)所獲得的2.5mL樣品到PD-10柱, 丟棄洗脫液。

    4)用初始緩沖液洗脫, 從PD-10柱中洗脫蛋白質,收集前3.5mL部分。

    5)所獲得的3.5mL樣品即可用于HPCF 1D柱的進樣分離分析階段。

    *為檢驗所獲得樣品的優劣,可取50uL上述已經交換過的樣品進樣到HPRP 2D柱,觀察所有蛋白的反相分離圖譜。在這一步,如果樣品制備有一些問題, 在分析譜圖后將會鑒別出來。注意:根據化合物和蛋白的量預測樣品,在這時應該得到一張“豪豬”狀的色譜圖(a very "spikey or porcupine" liking chromatogram),使你分析的樣品有意義, 如果沒有得到這樣的蛋白圖譜,請停止進行色譜聚焦分離分析, 繼續摸索樣品制備步驟和方法。


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