融合蛋白的設計大致分為基于重復結構、基于生長因子以及基于細胞粘附分子3類。
第1類融合蛋白中最典型的是來源于彈性蛋白( Elastin-Like Polymers，ELPs) 及絲素蛋白( Silk-Like Polymers，SLPs) 的融合蛋白。ELPs 是一種由數個重復的氨基酸序列組成的細胞外基質蛋白，由兩種短肽段交替排列構成，主要包括VPGZG、VPGVG、APGVGV、VPGFGCGAG以及VPGG 等5 種。
最著名的當屬VPGZG融合蛋白( Z可換為除了脯氨酸外任意氨基酸) 。重復的VPGVG 序列能夠使融合蛋白具有溫敏特性，將溫敏性ELP 與化學、酶、物理等多種交聯方式的水凝膠結合起來能夠衍生出多種應用方式。
ELPs 主要由甘氨酸、丙氨酸和絲氨酸組成，極易形成反向平行的β －折疊片層結構，具有多樣側鏈化學修飾位點，良好的熱穩定性和機械性能，在生物醫學上常用作手術縫合線，人工皮膚及軟骨修復材料。對于此類融合蛋白，只需通過調節其氨基酸序列和分子鏈長度，便能夠精確控制其對溫度、pH、離子強度的響應敏感性，從而實現可逆的溶解轉變。