本病的病因及發病機制十分復雜，迄今尚未完全明確，但近年的研究表明血栓性疾病的發生、發展主要與下列6種因素有關：
一、 血管內皮損傷當血管 內皮細胞因機械（如動脈粥樣硬化）、化學（如 藥物）、生物（如 內毒素）、免疫及血管自身病變等因素受損傷時，可促使 血栓形成。其發病機制為：
①內皮損傷、 內皮細胞TF過度表達及釋放， 外源性凝血途徑激活；
② 血管完整性破壞，FⅦ激活，內源性凝血途徑啟動；
③血小板粘附、聚集、釋放反應增加；
④ 內皮細胞受損，ET釋放，致 血管收縮、血流受阻。
二、 血小板數量增加，活性增強各種導致血小板數量增加、活性增強的因素，均有誘發、促進血栓性疾病發生的可能性，如血小板增多癥、機械、化學、生物及 免疫反應等導致的血小板破壞加速等。其致病機制與激活凝血反應等密切相關，詳見本篇第十五章。目前認為，血小板因素在 動脈血栓形成（如 心肌梗死）的發病中有更為重要的地位。
三、血液凝固性增高在多種生理及 病理狀態下，人體凝血活性可顯著增強，表現為某些 凝血因子水平升高或活性增加，如 妊娠、 高齡及創傷感染等所致的 應激反應、 高脂血癥、 惡性腫瘤等。而高凝狀態是血栓性疾病的發病基礎。
四、抗凝活性減低人體生理性抗凝活性減低，是血栓形成的重要條件。引起人體抗激活性減低的常見原因有：
①AT減少或缺乏；
②PC及PS缺乏癥；
③由FV等結構異常引起的抗蛋白C現象（APC-R），近年研究發現，在歐美白人反復發生深部 靜脈血栓形成或有陽性家族史的深部靜脈血栓形成（DVT）患者中，APC-R的發生率高達60%；④肝素輔因子Ⅱ（HC-Ⅱ）缺乏癥等。
五、纖溶活力降低臨床常見有：
①纖溶酶原結構或功能異常，如異常纖溶酶原血癥等；
②纖溶酶原激活劑（PA）釋放障礙；
③纖溶酶活化劑抑制物過多。這些因素導致人體對纖維蛋白的清除能力下降，有利于 血栓形成及擴大。
六、 血液流變學異常各種原因引起的血液粘滯度增高、紅細胞變形能力下降等，均可導致全身或局部血流淤滯、緩慢，為 血栓形成創造條件。如高纖維蛋白原血癥、 高脂血癥、 脫水、 紅細胞增多癥等。它可通過以下機制促進 血栓形成：
①紅細胞聚集成團，形成 紅色血栓；
②促進血小板與內皮的粘附及聚集，增強血小板活性；
③損傷 血管內皮，啟動凝血過程。