角蛋白酶是皮膚真菌重要的侵襲因子，因此，能否利用角蛋白酶抑制劑或者角蛋白酶單克隆抗體抑制角蛋白酶的作用，削弱皮膚真菌的侵襲性，從而達到治療皮膚真菌感染的目的，是今后研究角蛋白酶與皮膚真菌感染相互關系的一個重要方向。
迄今為止，尚缺乏研制角蛋白酶單克隆抗體在體表中和角蛋白酶削弱皮膚真菌的侵襲性報道。角蛋白酶具有高效的角蛋白水解活性，利用角蛋白酶改善藥物在角蛋白中的通透性，提高皮膚外用藥物的療效，特別是在銀屑病、角化過度性皮膚病（神經性皮炎、慢性濕疹等）和甲病中的治療應用值得研究。
角蛋白酶也可以應用于美容護膚品，幫助活性因子透過皮膚屏障，去除皮膚多余角質，實現皮膚的深層護理。角蛋白酶能水解毛發角蛋白，利用角蛋白酶進行脫毛，治療多毛癥也可能具有良好的應用前景。