四、呼吸道感染
呼吸道按解剖結構分為上呼吸道和下呼吸道。
◆上呼吸道感染主要指喉及喉以上的呼吸道感染。
◆下呼吸道感染主要指氣管、支氣管和肺的感染。
（一）上呼吸道的正常菌群
1.球菌 凝固酶陰性葡萄球菌，鏈球菌，微球菌，奈瑟菌，厭氧球菌。
2.桿菌 棒狀桿菌，嗜血桿菌，類桿菌，梭桿菌。
（二）常見病原微生物
（三）標本采集
1.采集方法
（1）上呼吸道：常采用鼻咽拭子；在扁桃體部位、咽后壁及口腔內炎癥、潰瘍或滲出部位采樣時，應先用清水漱口，再采集標本。
（2）下呼吸道：常采用自然咳痰法、支氣管鏡采集、胃內采集、咽拭子。清晨第一口痰為宜，最好在用抗菌藥物前采集，必須先用清水漱口，避免唾液混入。
2.立即送檢。
（四）檢驗方法
1.涂片：
◆檢查細菌常用革蘭染色、抗酸染色；
◆檢查隱球菌采用墨汁染色；
◆軍團菌、支原體、病毒等可用免疫熒光抗體染色。
◆合格的痰標本：
白細胞＞25個/低倍視野，鱗狀上皮細胞＜10個/低倍視野。
2.分離培養
（1）痰標本的前處理一般是用無菌生理鹽水將痰洗凈，再加入胰酶溶液使痰均質化。
（2）普通細菌培養采用血平板、中國藍瓊脂平板或麥康凱瓊脂平板、巧克力平板。
（五）臨床意義
◆注意采集合格的下呼吸道標本，以提高檢出率和陽性的正確率。
◆一些條件致病菌和耐藥菌成為醫院內肺炎的主要致病菌。
◆真菌性肺炎多為條件致病性真菌感染，常見的以白假絲酵母菌為主。
五、尿路感染
◆上尿路感染：主要有腎盂腎炎
◆下尿路感染：主要有膀胱炎和尿道炎
（一）常見病原微生物
（二）標本采集
1.采集時間 一般為晨起第1次尿送檢。
2.采集方法
◆清潔中段尿：常采用，采集標本前要用肥皂水或碘附清洗外陰（女性）或陰莖頭（男性）。
◆腎盂尿采集法；
◆膀胱穿刺法；
◆導尿法：最好，防止逆行性感染。
3.注意事項
◆嚴格進行無菌操作，盡量避免污染菌，立即送檢，不超過1h，尿中不得加任何防腐劑和消毒劑。
（三）分離培養
1.培養基的選擇
◆普通細菌選用血平板、中國藍瓊脂平板或麥康凱瓊脂平板。特殊細菌使用特殊、選擇培養基。
2.尿細菌定量培養。
（四）結果報告
1.陰性 一般48h無細菌生長。
2.陽性 菌落計數、鑒定及藥敏結果。
◆G-桿菌＞105cfu/ml； G+球菌＞104cfu/ml，有診斷意義。
◆G+球菌＜104cfu/ml，多為污染；G+球菌104～105cfu/ml，可疑陽性。
3.尿路感染的細菌數少于105CFU／ml時多見于以下幾種情況：
◆應用抗菌藥物，尿中細菌發育受到抑制；
◆使用低敏感性藥物，大多數細菌停留在104CFU／ml；
◆尿濃度變化大時及pH在5.0以下8.5以上，則發育受阻；
◆尿頻時；
◆病原菌發育要求條件高時；
◆采尿時外陰部消毒劑混入尿中。
六、消化道感染
（一）常見病原菌
◆腸毒素為主的病原菌： 金葡，霍亂弧菌，志賀菌，ETEC/EHEC/EAggEC，產氣莢膜梭菌，艱難梭菌
◆侵襲性為主的病原菌： 沙門菌，志賀菌，EPEC/EIEC，小腸結腸炎耶爾森菌，副溶血弧菌，結核分枝桿菌，白假絲酵母菌
◆病毒：輪狀病毒，埃克病毒，Norwalk病毒，腺病毒
（二）標本采集與運送
1.采集時間 急性期、盡量在用藥前采集。
2.采集方法
◆自然排便采集法、直腸拭子。
◆標本不能及時接種時，應在標本中加保護劑或用相應的運輸培養基。
（三）分離培養
培養基的選擇：
◆普通致病菌如沙門菌、志賀菌等可選用SS瓊脂平板、中國藍瓊脂平板或麥康凱瓊脂平板。
◆特殊細菌如彎曲菌、弧菌、厭氧菌等選擇相應的選擇性培養基。
◆病毒可用細胞培養。
（四）臨床意義
◆感染性腹瀉由多種病原體感染所致。
◆消化性潰瘍由幽門螺桿菌感染引起。
◆輪狀病毒常引起幼兒腹瀉，腺病毒是引起兒童腹瀉的主要病原，還可引起成人腹瀉，埃可病毒常引起嬰幼兒腹瀉，Norwalk病毒常感染成人和大齡兒童。
七、性傳播疾病
性傳播疾病（STD）：以性行為為主要傳播途徑的-組傳染病。
（一）常見性傳播疾病及其病原體
性傳播疾病：梅毒、淋病、軟下疳、性病淋巴肉芽腫、細菌性陰道病、非淋菌性尿道炎、尖銳濕疣、生殖器皰疹、病原體 、梅毒螺旋體、淋病奈瑟菌、杜克嗜血桿菌、沙眼衣原體性病淋巴肉芽腫生物亞種、陰道加德納菌和類桿菌等厭氧菌、沙眼衣原體沙眼生物亞種、支原體、人乳頭瘤病毒、人類單純皰疹病毒2型
（二）標本采集
◆拭子取尿道膿性分泌物（男性）或宮頸分泌物（女性），供培養及鏡檢；
◆梅毒病人取皮膚滲出液和淋巴穿刺液涂片；
◆皰疹抽取皰內液體，或刺破小皰后，用無菌拭子采樣。
八、創傷和外科感染
（一）常見病原菌
（二）標本采集
◆組織創傷用拭子采集標本；
◆施行清創術時，可選擇合適部位采集標本送檢；
◆骨髓炎病人應取骨髓活檢標本，如損害部位已形成竇道，可采取竇道引流液；
◆膿腫時取內部膿汁及膿腫壁標本。
（三）臨床意義
◆由創傷、手術、侵入性器械操作等外科治療引起的感染最為常見。
◆感染以化膿性炎癥改變為主。外傷性創傷感染以葡萄球菌和鏈球菌多見。
◆深部創傷易引起破傷風和氣性壞疽。
◆燒傷創面以革蘭陰性桿菌最常見，次為革蘭陽性球菌感染。
◆急性化膿性骨關節炎常由金黃色葡萄球菌、化膿性鏈球菌、肺炎鏈球菌、淋病奈瑟菌感染所致。
◆慢性化膿性骨關節炎、慢性骨髓炎常由結核分枝桿菌引起，葡萄球菌、鏈球菌也常見。