近日,我組在糖苷類化合物規模化注釋方面取得新進展。通過構建in silico苷元庫和糖基/酰基-糖基碎裂模式庫,以及發展利于苷元離子檢出的LC-HR MS/MS分析條件,建立了苷元離子的高通量識別方法以及高效去除假陽性候選結果的方法,并開發了相應的糖苷類化合物規模化注釋程序plantMS2(https://github.com/zhengfj1994/plantMS2)。
糖苷類化合物是一類重要的次生代謝產物,在植物生長發育過程中起著關鍵作用,全景注釋植物中已知和未知糖苷類化合物具有重要的研究意義。由于市售標準品和數據庫收錄的二級質譜規模有限,現有的基于液相色譜-高分辨質譜(HRMS)的糖苷類成分注釋方法難以有效地對糖苷類化合物進行注釋、定性。
研究團隊發展了一種基于液相色譜-HRMS/MS的糖苷類化合物規模化定性新方法。構建了具有植物種屬特異性的in silico苷元庫以及糖基/酰基-糖基的in silico碎裂模式庫。優化出利于苷元離子檢出率的LC-HR MS/MS分析條件,并建立了苷元離子的高通量識別方法。最后,通過候選糖苷-苷元質譜相似性發展了高效去除假陽性候選結果的方法。方法評估表明,該注釋流程適用于多種類型的HRMS儀器不同碎裂模式(HCD和CID等)下建立的方法,定性準確性和特異性均優于現有注釋方法。將該方法應用于玉米葉片,種子和花絲中糖苷類成分的注釋,共注釋出274個糖苷類成分。
相關研究成果以“Novel Method for Comprehensive Annotation of Plant Glycosides Based on Untargeted LC-HRMS/MS Metabolomics”為題,發表在Analytical Chemistry上。該工作的第一作者是我組博士研究生張秀瓊,通訊作者為路鑫和許國旺。上述工作得到了國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目的資助。
文章鏈接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.2c02362(文/圖 張秀瓊)
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